依據疾管署監測資料顯示，國內腸病毒疫情仍處流行期，近四週門、急診就診總人次為13,430、10,938、13,109、13,843，第44週較前ㄧ週略升5.6%，急診就診千分比（5.93）仍高於流行閾值（4.35），社區主要流行病毒株為克沙奇A16型。今年迄今共計5例重症個案，3例感染克沙奇B5型、2例感染克沙奇A16型，其中1例克沙奇B5型及1例克沙奇A16型為死亡個案。
另依疾管署法傳腸病毒重症與社區腸病毒輕症監視資料顯示，今年9月起零星檢出腸病毒71型檢體，主要發生於宜蘭縣。台灣過去曾於2008年及2011至2012年間發生過腸病毒71型的流行，至今已三年沒出現大流行。由於今年4至6月首波腸病毒疫情並無明顯高峰，推測仍有多數孩童不具免疫力，自9月開學後次波疫情持續發生，雖多屬輕症，請民眾仍不能掉以輕心，疾管署� ��持續密切監測各型別腸病毒的活動情形。
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